| Datum | Spieler | Von | Zu | Zahlung / Abrechnung | Dauer | |
| 07.04.2022 13:22 | Rolf Fürst | Blau-Weiß Lustenau | FC Flora Pärnu | 98.567 | Euro | 36 ZATs |
| 05.12.2017 09:30 | Maleachi Jabotinsky | NL Brotnja Citluk | FC Flora Pärnu | 49.207 | Euro | 36 ZATs |
| 01.03.2017 17:49 | Felix Dascalescu | FC Mare Bukarest | FC Flora Pärnu | 120.124 | Euro | 36 ZATs |
| 05.08.2015 10:57 | Joel Niva | FC Flora Pärnu | Eintracht Wuppertal | 44.401 | Euro | 36 ZATs |
| 25.11.2014 23:52 | Igor Tirel | FC Flora Pärnu | Suduva Rudiskes | 179.641 | Euro | 36 ZATs |
| 06.09.2012 19:48 | Aziz Anisimov | Polar Narva | FC Flora Pärnu | 63.443 | Euro | 36 ZATs |
| 06.09.2012 19:39 | Reymond Sparks | Polar Narva | FC Flora Pärnu | 57.148 | Euro | 36 ZATs |